在聖彼得堡鎮下游五公里的地方，密西西比河寬約兩公里，有一個狹長的無人島，叫做「傑克遜島」。島上林木繁茂，前方有片很淺的沙灘，離對岸不遠，而那塊河岸也是人跡罕至的茂林。他們決定流浪到這個島上，至於當海盜要做什麼還沒多想。接著，他們還找了哈克入夥，一起擬定了半夜出走的計畫。
半夜時分，「西班牙海上黑衣大盜」湯姆･索耶、「嗜血魔王」哈克·貝利，以及「海上霸王」喬伊･哈珀，帶著各自從家裡偷出來的食物，來到河邊會合。這些是湯姆從他喜歡的書裡挑中，給每個海盜夥伴的封號。
他們偷了一艘木筏，由湯姆指揮，哈克划右槳，喬伊划尾槳，威風凜凜地出發了。木筏逐漸地遠離小鎮，湯姆再「最後再看一眼」那給了他歡樂又帶來苦悶的地方。它在星光點點、波光粼粼的河岸，平靜而安詳，絲毫沒有受到驚擾。
來到島上，他們把食物從木筏上搬下來，找到一張被遺棄的帆布搭了一個帳篷。他們在一根倒伏於地的大樹幹旁生起火，心滿意足地圍著火堆，躺在草地上。
「這蠻快活的對嗎？」喬伊說：「要是其他人能瞧見我們，他們會怎麼說？」
「哈，他們會羨慕得要命。」湯姆說：「在這兒不必一大早就起床，不必上學，也不必洗臉。你說對不對，哈克？」
「我猜是這樣。」哈克說：「在這兒，也沒誰來欺負你。」
聊著聊著，夜漸漸深了，幾個孩子在火光中沉沉睡去，只是「良心」那傢伙盤踞心頭，讓他們隱隱約約覺得從家裡逃出來是個錯誤。。
早晨，湯姆在清脆的鳥鳴聲中醒來，一時間以為自己還在家裡。他揉揉眼睛，向四周看了看，這才想起自己身在何處。湯姆搖醒兩位同伴，開心地跳進沙灘上那片清澈透底的水中互相追逐、玩鬧了一陣子。他們神清氣爽地返回營地，喬伊開始做早餐，湯姆和哈克拿了釣魚竿，到附近的河邊釣魚，轉眼間，幾條肥碩的鱸魚也上了餐桌。
吃完早餐，他們隨意在樹蔭下休息片刻，便踏上了森林探險之旅。林中茂盛的大樹上披垂著一根根葡萄藤，好像王冠上垂下來的流蘇；青翠的草地上點綴著珠寶般美麗的花朵，令人眼花撩亂；不過並沒有發現什麼稀奇有趣的玩意兒。
不知不覺，一天過去了。入夜後，森林籠罩著寂靜和孤獨感，湯姆和喬伊不知不覺都開始想家，可是他們誰也不好意思說出來。
這時候，遠處隱約傳來奇怪的聲響，漸漸聽到一陣陣隆隆聲和喧鬧聲。他們趕到岸邊一看，河面上一艘渡船正順流而下，寬大的甲板上似乎擠滿了人。突然，有人點燃炮竹丟進河裡，爆炸發出「砰砰」的聲音，瞬間水花四濺。湯姆突然明白了過來，那是鎮上找尋落水失蹤者的方法，他們認為這樣能讓溺斃河中的人浮出水面。
「大家是在找我們！他們以為我們淹死了！」湯姆大喊。
這幾個孩子瞬間覺得自己成了英雄。這是可喜可賀的勝利，由此可見有人在尋找他們，哀悼他們，對他們的失蹤而感到自責。最重要的是，想到自己成了全鎮談論的焦點，讓其他孩子羨慕又忌妒，他們心裡就得意揚揚。
當夜幕低垂，人們一無所獲地回家了。回到營地的孩子，坐在那兒看火光，心不在焉。得意的想法過去後，他們不由自主地想起家人對這樣過火的玩笑，絕對笑不出來，心情一陣不安。喬伊羞澀地提出想要回家，卻被湯姆奚落嘲笑了一番。
夜深人靜，哈克和喬伊早已鼾聲大作，湯姆卻輕輕地爬起來，找到幾片樹皮，用尖石寫了幾個字，留了一片在喬伊的帽子裡。然後他踮起腳尖，小心翼翼地穿越樹林，直到他認為別人已經聽不到腳步聲，立刻拔腿向沙灘飛奔而去。
湯姆偷偷回到了對岸。他飛快地跑過幾條冷冷清清的小巷，乘著夜色潛回波莉姨媽房裡，鑽到床底下藏起來。這時，湯姆發現屋裡坐著波莉姨媽、希德、瑪麗和哈珀太太。
「他不壞，他不過是淘氣罷了，冒冒失失的，就還是個毛頭孩子嘛。」波莉姨媽哭哭啼啼地說：「他可沒有一點壞心眼，我從來還沒見過像他那麼心地善良的孩子……」
哈珀太太也泣不成聲：「我不該不分青紅皂白就說喬伊偷吃了乳酪，還打了他。我怎麼就不記得是奶酪酸了，我自己倒掉的！好了，這下子，我別想活著見到他了。」
湯姆聽得鼻子發酸，有點想掉淚。姨媽傷心的樣子深深地感動他，讓他有一股衝動想從床底下衝出來，讓她驚喜欲狂；再說，湯姆也十分喜歡製造些充滿戲劇性的場面。但這一次他卻沉住氣，沒有任何動靜。
接下來，湯姆從他們的聊天內容中聽出一些端倪：人們以為他們幾個出去玩的時候溺水，白天到河中找屍體也沒找著，所有希望都破滅了。於是大家決定禮拜天為他們舉行葬禮。湯姆聽到這裡，渾身一陣簌簌亂抖。
喬伊的母親離開後，希德和瑪麗也各自回房。波莉姨媽在床邊跪下來，聲音顫抖著為湯姆祈禱，話語中充滿著愛意。雖然上床還是輾轉難眠，不時地發出長吁短歎，許久才伴隨著淚水慢慢睡去。湯姆這時才悄悄爬出來，從口袋裡掏出一片寫了字的樹皮，放在桌上。親了親睡熟的姨媽後，湯姆又不聲不響地離開 。
回到營地時，天已大亮，湯姆聽見喬伊說：「湯姆是最守信用的，他會回來，他不會拋棄我們。他知道這樣做，對一個海盜來說是種恥辱，像湯姆這樣愛面子的人，是不會做出這種事情的。他一定是有事出去了。不過，他究竟幹什麼去了呢？」
「看誰回來了！」湯姆喊了一聲，戲劇十足的大步走了進來。
經過一夜折騰，湯姆感到飢腸轆轆。他狼吞虎嚥地吃了豐富的早餐，這才添油加醋地講述了一番這次回家的所見所聞。他們成了一群自命不凡的英雄。
然後湯姆就躲到一個陰涼幽靜的地方睡覺，一直睡到中午。午後，這幫「海盜」全體出動，在河岸四下尋覓，找到許多雪白的烏龜蛋，做了一頓美味可口的煎蛋。
轉眼間，離家已經四天。三個孩子走在沙灘上打水仗，但沒多久就個個意興闌珊，不時眼巴巴地望向對岸的小鎮。湯姆發現自己不由自主地用腳趾頭在沙灘上寫了「貝琪」。他把字跡抹掉，對自己大為惱火，恨自己意志薄弱。喬伊情緒更是低落，他想家想得快哭了；哈克也悶悶不樂。
「喂，我說，夥伴們，就此罷手吧。我要回家，這實在太寂寞了。」喬伊終於忍不住，抬腿直接往木筏走去；哈克也跟了上去。
湯姆站在那裡，心裡激烈地交戰著，真想拋開自尊跟著他們走。他忽然覺得周圍如此冷清，如此寂寞。在和自尊作了最後一次較量後，他終於奔向兩個夥伴，一邊跑一邊喊：「等等！等等！我有話要跟你們講！」
喬伊和哈克起初還不情願，但最後還是停下腳。聽了湯姆一番話後，不禁狂呼，連連讚歎：「這個主意太妙了！」孩子們興高采烈地返回營地，雀躍不已，一邊滔滔不絕地談論著湯姆那個出色的計畫。
午夜時分，空氣又悶又熱，似乎要變天了。幾個孩子醒了過來，不一會兒，天空突然劃過一道閃電，將黑夜照得亮如白晝。一股涼颼颼的風吹過來，搖得樹葉沙沙作響。幾個孩子嚇得緊緊抱成一團。雷聲轟隆作響，狂風夾著雨點，劈哩啪啦地打在他們身上。
「快，大家快進帳篷！」湯姆喊道。
炫目的閃電一道接著一道，大雨傾盆而下。孩子們狼狽不堪地躲在帳篷下面，暴風雨越來越猛烈，「嘩啦」一聲捲走了帳篷，他們趕緊慌忙地再找地方避雨，三個人緊握彼此的手，連滾帶爬、滿身瘀傷地逃到一棵大橡樹下。
暴風雨達到高潮，它那無比的威力，彷彿要把小島撕成碎片、燃燒殆盡。對這些無家可歸、餐風露宿的孩子來說，這真是一個瘋狂的夜晚。
風雨漸漸平息，大地又恢復了平靜。三個孩子回到營地，發現遮蔽他們的大樹已被閃電劈成兩半，很慶幸他們當時未在現場。三人全身濕透，渾身發冷。他們找到一點倖存的乾木頭，好不容易重新點燃了營火，談起這場午夜驚奇，反正也找不到乾地可睡覺，就這樣一直聊到天亮。
太陽漸漸升起，照耀在孩子們的身上。經過一夜的驚險和折騰，孩子個個筋疲力盡，全身僵硬。吃完早餐後，他們感到心情煩躁，又開始想家了。
半夜時分，「西班牙海上黑衣大盜」湯姆･索耶、「嗜血魔王」哈克·貝利，以及「海上霸王」喬伊･哈珀，帶著各自從家裡偷出來的食物，來到河邊會合。這些是湯姆從他喜歡的書裡挑中，給每個海盜夥伴的封號。
他們偷了一艘木筏，由湯姆指揮，哈克划右槳，喬伊划尾槳，威風凜凜地出發了。木筏逐漸地遠離小鎮，湯姆再「最後再看一眼」那給了他歡樂又帶來苦悶的地方。它在星光點點、波光粼粼的河岸，平靜而安詳，絲毫沒有受到驚擾。
來到島上，他們把食物從木筏上搬下來，找到一張被遺棄的帆布搭了一個帳篷。他們在一根倒伏於地的大樹幹旁生起火，心滿意足地圍著火堆，躺在草地上。
「這蠻快活的對嗎？」喬伊說：「要是其他人能瞧見我們，他們會怎麼說？」
「哈，他們會羨慕得要命。」湯姆說：「在這兒不必一大早就起床，不必上學，也不必洗臉。你說對不對，哈克？」
「我猜是這樣。」哈克說：「在這兒，也沒誰來欺負你。」
聊著聊著，夜漸漸深了，幾個孩子在火光中沉沉睡去，只是「良心」那傢伙盤踞心頭，讓他們隱隱約約覺得從家裡逃出來是個錯誤。。
早晨，湯姆在清脆的鳥鳴聲中醒來，一時間以為自己還在家裡。他揉揉眼睛，向四周看了看，這才想起自己身在何處。湯姆搖醒兩位同伴，開心地跳進沙灘上那片清澈透底的水中互相追逐、玩鬧了一陣子。他們神清氣爽地返回營地，喬伊開始做早餐，湯姆和哈克拿了釣魚竿，到附近的河邊釣魚，轉眼間，幾條肥碩的鱸魚也上了餐桌。
吃完早餐，他們隨意在樹蔭下休息片刻，便踏上了森林探險之旅。林中茂盛的大樹上披垂著一根根葡萄藤，好像王冠上垂下來的流蘇；青翠的草地上點綴著珠寶般美麗的花朵，令人眼花撩亂；不過並沒有發現什麼稀奇有趣的玩意兒。
不知不覺，一天過去了。入夜後，森林籠罩著寂靜和孤獨感，湯姆和喬伊不知不覺都開始想家，可是他們誰也不好意思說出來。
這時候，遠處隱約傳來奇怪的聲響，漸漸聽到一陣陣隆隆聲和喧鬧聲。他們趕到岸邊一看，河面上一艘渡船正順流而下，寬大的甲板上似乎擠滿了人。突然，有人點燃炮竹丟進河裡，爆炸發出「砰砰」的聲音，瞬間水花四濺。湯姆突然明白了過來，那是鎮上找尋落水失蹤者的方法，他們認為這樣能讓溺斃河中的人浮出水面。
「大家是在找我們！他們以為我們淹死了！」湯姆大喊。
這幾個孩子瞬間覺得自己成了英雄。這是可喜可賀的勝利，由此可見有人在尋找他們，哀悼他們，對他們的失蹤而感到自責。最重要的是，想到自己成了全鎮談論的焦點，讓其他孩子羨慕又忌妒，他們心裡就得意揚揚。
當夜幕低垂，人們一無所獲地回家了。回到營地的孩子，坐在那兒看火光，心不在焉。得意的想法過去後，他們不由自主地想起家人對這樣過火的玩笑，絕對笑不出來，心情一陣不安。喬伊羞澀地提出想要回家，卻被湯姆奚落嘲笑了一番。
夜深人靜，哈克和喬伊早已鼾聲大作，湯姆卻輕輕地爬起來，找到幾片樹皮，用尖石寫了幾個字，留了一片在喬伊的帽子裡。然後他踮起腳尖，小心翼翼地穿越樹林，直到他認為別人已經聽不到腳步聲，立刻拔腿向沙灘飛奔而去。
湯姆偷偷回到了對岸。他飛快地跑過幾條冷冷清清的小巷，乘著夜色潛回波莉姨媽房裡，鑽到床底下藏起來。這時，湯姆發現屋裡坐著波莉姨媽、希德、瑪麗和哈珀太太。
「他不壞，他不過是淘氣罷了，冒冒失失的，就還是個毛頭孩子嘛。」波莉姨媽哭哭啼啼地說：「他可沒有一點壞心眼，我從來還沒見過像他那麼心地善良的孩子……」
哈珀太太也泣不成聲：「我不該不分青紅皂白就說喬伊偷吃了乳酪，還打了他。我怎麼就不記得是奶酪酸了，我自己倒掉的！好了，這下子，我別想活著見到他了。」
湯姆聽得鼻子發酸，有點想掉淚。姨媽傷心的樣子深深地感動他，讓他有一股衝動想從床底下衝出來，讓她驚喜欲狂；再說，湯姆也十分喜歡製造些充滿戲劇性的場面。但這一次他卻沉住氣，沒有任何動靜。
接下來，湯姆從他們的聊天內容中聽出一些端倪：人們以為他們幾個出去玩的時候溺水，白天到河中找屍體也沒找著，所有希望都破滅了。於是大家決定禮拜天為他們舉行葬禮。湯姆聽到這裡，渾身一陣簌簌亂抖。
喬伊的母親離開後，希德和瑪麗也各自回房。波莉姨媽在床邊跪下來，聲音顫抖著為湯姆祈禱，話語中充滿著愛意。雖然上床還是輾轉難眠，不時地發出長吁短歎，許久才伴隨著淚水慢慢睡去。湯姆這時才悄悄爬出來，從口袋裡掏出一片寫了字的樹皮，放在桌上。親了親睡熟的姨媽後，湯姆又不聲不響地離開 。
回到營地時，天已大亮，湯姆聽見喬伊說：「湯姆是最守信用的，他會回來，他不會拋棄我們。他知道這樣做，對一個海盜來說是種恥辱，像湯姆這樣愛面子的人，是不會做出這種事情的。他一定是有事出去了。不過，他究竟幹什麼去了呢？」
「看誰回來了！」湯姆喊了一聲，戲劇十足的大步走了進來。
經過一夜折騰，湯姆感到飢腸轆轆。他狼吞虎嚥地吃了豐富的早餐，這才添油加醋地講述了一番這次回家的所見所聞。他們成了一群自命不凡的英雄。
然後湯姆就躲到一個陰涼幽靜的地方睡覺，一直睡到中午。午後，這幫「海盜」全體出動，在河岸四下尋覓，找到許多雪白的烏龜蛋，做了一頓美味可口的煎蛋。
轉眼間，離家已經四天。三個孩子走在沙灘上打水仗，但沒多久就個個意興闌珊，不時眼巴巴地望向對岸的小鎮。湯姆發現自己不由自主地用腳趾頭在沙灘上寫了「貝琪」。他把字跡抹掉，對自己大為惱火，恨自己意志薄弱。喬伊情緒更是低落，他想家想得快哭了；哈克也悶悶不樂。
「喂，我說，夥伴們，就此罷手吧。我要回家，這實在太寂寞了。」喬伊終於忍不住，抬腿直接往木筏走去；哈克也跟了上去。
湯姆站在那裡，心裡激烈地交戰著，真想拋開自尊跟著他們走。他忽然覺得周圍如此冷清，如此寂寞。在和自尊作了最後一次較量後，他終於奔向兩個夥伴，一邊跑一邊喊：「等等！等等！我有話要跟你們講！」
喬伊和哈克起初還不情願，但最後還是停下腳。聽了湯姆一番話後，不禁狂呼，連連讚歎：「這個主意太妙了！」孩子們興高采烈地返回營地，雀躍不已，一邊滔滔不絕地談論著湯姆那個出色的計畫。
午夜時分，空氣又悶又熱，似乎要變天了。幾個孩子醒了過來，不一會兒，天空突然劃過一道閃電，將黑夜照得亮如白晝。一股涼颼颼的風吹過來，搖得樹葉沙沙作響。幾個孩子嚇得緊緊抱成一團。雷聲轟隆作響，狂風夾著雨點，劈哩啪啦地打在他們身上。
「快，大家快進帳篷！」湯姆喊道。
炫目的閃電一道接著一道，大雨傾盆而下。孩子們狼狽不堪地躲在帳篷下面，暴風雨越來越猛烈，「嘩啦」一聲捲走了帳篷，他們趕緊慌忙地再找地方避雨，三個人緊握彼此的手，連滾帶爬、滿身瘀傷地逃到一棵大橡樹下。
暴風雨達到高潮，它那無比的威力，彷彿要把小島撕成碎片、燃燒殆盡。對這些無家可歸、餐風露宿的孩子來說，這真是一個瘋狂的夜晚。
風雨漸漸平息，大地又恢復了平靜。三個孩子回到營地，發現遮蔽他們的大樹已被閃電劈成兩半，很慶幸他們當時未在現場。三人全身濕透，渾身發冷。他們找到一點倖存的乾木頭，好不容易重新點燃了營火，談起這場午夜驚奇，反正也找不到乾地可睡覺，就這樣一直聊到天亮。
太陽漸漸升起，照耀在孩子們的身上。經過一夜的驚險和折騰，孩子個個筋疲力盡，全身僵硬。吃完早餐後，他們感到心情煩躁，又開始想家了。
