「我們從哪裡來？我們要往哪裡去？」，自古以來宗教對於起源有各種不同的看法，科學界也沒有一個合理的解釋，沒有人可以證明自己是對的，或者別人是錯的。直到現在，有一項科學發現可以回答這個問題。
故事開頭一位未來學家愛德蒙．柯許在世界宗教大會會見宗教界的三位領袖，並向他們展示一項能夠顛覆宗教界的一項研究，愛德蒙表示將在一個月後公布這項研究，後來三人又意外發現愛德蒙其實將在三日後就要演講，這三位領袖將不惜代價阻止愛德蒙的演講。愛德蒙按照計畫在三日後演講，並邀請之前的老師羅伯．蘭登。演講當日，正到高潮之際，愛德蒙．柯許的量子電腦人工智慧助理溫斯頓發現有人混進演講現場，幾秒鐘後，愛德蒙柯許慘遭案殺，羅伯．蘭登和胡利安王子的未婚妻安布拉．維達必需抓出兇手且代替愛德蒙公布他的研究發現。
故事的最後，愛德蒙在簡報中提到他根據物理定律和熵增的原則類比且加速了米勒-尤里實驗，證明生命可以通過化學完全自發產生，接著愛德蒙又透過類比預測人類將在五十年後消失，與科技融為一體，造就美好的未來。
這本書在在解尾寫道「讓黑暗的宗教離去，讓甜美的科學主宰」，我認為這本書不是說宗教是黑暗的應要離去，而是「黑暗的」宗教應要離去，宗教有分兩種一種是壓迫思考，教條式的宗教，令一種是鼓勵自我反省，開放式的宗教，其實科學也算是一種宗教，即使神都是人們創造出來的的，宗教也不盡然都是「黑暗的」。